综合部由多名享受国务院特殊津贴的资深航海专家及一批优秀的海事管理、港口管理、航道管理技术人员组成，部门致力于为客户提供科学化、规范化的通航安全论证，最大限度避免水上水下建设工程对船舶通航的影响，最大程度保障通航安全、维护通航秩序。部门成立以来，承担了“虎门航道综合整治”、“威远岛环岛路扩建二期工程”及南沙港第三期扩建工程 ——“南沙近洋码头”等项目的通航安全评估论证，得到了海事主管机关及业主的一致好评。